Proizvodi

Infracrvena spektroskopija je korištena za mapiranje interakcija supstrat-protein: konformacijske promjene sarkoplazmatskog retikuluma Ca(2+)-ATPaze nakon vezivanja nukleotida i fosforilacije ATPaze praćene su korištenjem supstratnih ATP i ATP analoga (2'-deoksi-ATP, '-deoksi-ATP i inozin 5'-trifosfat), koji su modificirani na specifičnim funkcionalnim grupama supstrata.Modifikacije 2'-OH, 3'-OH i amino grupe adenina smanjuju stepen konformacijske promjene ATPaze izazvane vezivanjem, s posebno jakim efektima uočenim za posljednja dva.Ovo pokazuje strukturnu osjetljivost kompleksa nukleotid-ATPaza na pojedinačne interakcije između nukleotida i ATPaze.Sve proučavane grupe su važne za vezivanje i interakcije date grupe liganda sa ATPazom zavise od interakcija drugih ligandnih grupa.Fosforilacija ATPaze je uočena za ITP i 2'-deoksi-ATP, ali ne i za 3'-deoksi-ATP.Ne postoji direktna veza između obima konformacijske promjene nakon vezivanja nukleotida i brzine fosforilacije, što pokazuje da puni obim konformacijske promjene izazvane ATP-om nije obavezan za fosforilaciju.Kao što je uočeno za kompleks nukleotid-ATPaza, konformacija prvog fosforiliranog intermedijera ATPaze E1PCa(2) također ovisi o nukleotidu, što ukazuje da ATPazna stanja imaju manje ujednačenu konformaciju nego što se prethodno očekivalo.