Proizvodi

Nealkoholna masna bolest jetre (NAFLD) ima širok spektar bolesnih stanja u rasponu od blage steatoze koju karakterizira abnormalno zadržavanje lipida u stanicama jetre do steatohepatitisa (NASH) koji pokazuje nakupljanje masti, upalu, baloniranje i degradaciju hepatocita i fibrozu.Na kraju, steatohepatitis može rezultirati cirozom jetre i hepatocelularnim karcinomom. U ovoj studiji analizirali smo tri različita soja miševa, A/J, C57BL/6J i PWD/PhJ, koji pokazuju različite stupnjeve steatohepatitisa kada im se daje 3,5-dietoksikarbonil. Dijeta koja sadrži -1,4-dihidrokolidin (DDC).Analiza ekspresije gena RNA-Seq, analiza proteina i metaboličko profiliranje primijenjeni su za identifikaciju različito eksprimiranih gena/proteina i poremećenih nivoa metabolita u uzorcima jetre miša nakon DDC tretmana.Analiza puteva otkrila je promjenu metabolizma arahidonske kiseline (AA) i S-adenozilmetionina (SAMe) u odnosu na druge puteve.Da bi se razumjele metaboličke promjene metabolizma arahidonske kiseline u svjetlu profila ekspresije bolesti, razvijen je kinetički model ovog puta koji je optimiziran prema razinama metabolita.Nakon toga, model je korišten za proučavanje in silico efekata potencijalnih ciljeva lijeka za steatohepatitis. Identifikovali smo metabolizam AA/eikozanoida kao jako poremećen kod miševa izazvanih DDC koristeći kombinaciju eksperimentalnog i in silico pristupa.Naša analiza AA/eikozanoidnog metaboličkog puta sugerira da su 5-hidroksieikozatetraenska kiselina (5-HETE), 15-hidroksieikozatetraenska kiselina (15-HETE) i prostaglandin D2 (PGD2) poremećeni kod DDC miševa.Nadalje pokazujemo da se dinamički model može koristiti za kvalitativno predviđanje metaboličkih promjena na osnovu podataka transkriptomije u kontekstu bolesti.Nadalje, identificiran je metabolizam SAMe kao poremećen zbog DDC tretmana.Nekoliko gena kao i neki metaboliti ovog modula pokazuju razlike između A/J i C57BL/6J s jedne strane i PWD/PhJ s druge strane.